יהונתן נולד ב-1940.9.8, בן שלישי לסוסיה ואריה אברך, אח להלל ולזיוה (שנפטרה בינקותה). בהיותו בן חמש נהרג אביו בתאונת עבודה. שנותיו הראשונות בבית
שמואל פונדיק אז מה פונדיק, מי ישיר השנה את "הא לחמא" ואת "אמר רבי אליעזר"? ומי יתמוך במקהלה בקול בס, חזק ובוטח הנותן